Gagasan GERMAS lahir dari keprihatinan terhadap kondisi kesehatan masyarakat Indonesia. Masyarakat Indonesia menghadapi beban ganda penyakit secara bersamaan. Di satu sisi, penyakit menular belum tuntas pemerintah tangani. Di sisi lain, penyakit tidak menular seperti diabetes, hipertensi, stroke, dan kanker terus meningkat.

Pada tahun 2016, Presiden Joko Widodo menginisiasi GERMAS sebagai gerakan nasional lintas sektor. Pemerintah Indonesia secara resmi meluncurkan gerakan ini pada 15 November 2016 di Kota Solo. Ribuan masyarakat mengikuti kegiatan olahraga bersama sebagai tanda peluncuran resmi GERMAS. Dengan demikian, GERMAS resmi hadir sebagai gerakan kesehatan nasional yang melibatkan seluruh elemen bangsa.

Pada tahun 2017, Presiden memperkuat GERMAS melalui Instruksi Presiden Nomor 1 Tahun 2017. Instruksi ini mewajibkan seluruh kementerian dan lembaga mendukung program GERMAS. Selain itu, pemerintah daerah juga wajib mengimplementasikan program ini di wilayah masing-masing. Oleh karena itu, GERMAS kini memiliki landasan hukum yang kuat di tingkat nasional maupun daerah.